EDI制水系统在长期运行过程中会由于水中杂质及污染物质致其堵塞，影响产水效果，所以为了延长设备使用寿命，必须对其进行合理的维护及清洗。
单个膜块清洗时药液配用量：
1、酸洗温度15-25℃。
2、碱洗温度25-30℃。
3、配药液用水必须是RO产水或高于RO产水的去离子水。
对于膜块数量大于1块时，按表中配液的数量乘以膜块数量。
EDI膜块的再生：
1、确认EDI膜块内没有任何的化学药品残留存在。
2、使系统构建成一个闭路自循环管路。
3、按照正常运行的模式调节好所有的流量和压力。
4、给EDI送电，调节电流从1A开始分步缓慢向EDI加载电流(最大不能超过6A)。
5、直至产水电阻率达工艺要求到或者≥14.5MΩ.cm。
6、注意膜块的再生是一个比较长的时间，有时可能会长达10-24小时甚至更长的时间。